參考文獻(xiàn)：https://doi.org/10.1002/advs.202410080

2025年3月24日，臨港實驗室殷憲振/上海藥物所高召兵/張小川團隊在Advanced Science上發(fā)表了題為“Generation of a High-Precision Whole Liver Panorama and Cross-Scale 3D Pathological Analysis for Hepatic Fibrosis”的研究性論文。本研究利用MOST系統(tǒng)結(jié)合肝臟尼氏染色技術(shù)，構(gòu)建高精度全肝圖譜及肝纖維化的跨尺度3D病理模型。研究發(fā)現(xiàn)肝纖維化時，肝臟多結(jié)構(gòu)出現(xiàn)區(qū)域特異性變化，如中央靜脈直徑減小、長度密度增加，肝竇受損，肝細(xì)胞脂肪變性且其程度與距中央靜脈距離相關(guān)。這一成果為肝臟疾病病理研究提供新視角與方法，有助于深入理解肝纖維化機制，為肝臟疾病診療及藥物研發(fā)提供理論依據(jù)。

原文鏈接：https://doi.org/10.1002/advs.202502744

2025年3月26日，中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）和腦認(rèn)知與類腦智能全國重點實驗室牽頭，聯(lián)合華中科技大學(xué)蘇州腦空間信息研究院以及國內(nèi)外多家機構(gòu)在《Nature Neuroscience》在線發(fā)表了題為《Projectome-based characterization of hypothalamic peptidergic neurons in male mice》的研究論文, 系統(tǒng)描繪了雄性小鼠下丘腦多肽能神經(jīng)元的全腦投射模式。本研究利用高分辨率的順行追蹤技術(shù)，在單細(xì)胞層面系統(tǒng)描繪了來自16類神經(jīng)肽群體、共7180個下丘腦神經(jīng)元的全腦投射圖譜，并建立了高分辨率的單神經(jīng)元投射數(shù)據(jù)庫（https://mouse.braindatacenter.cn/hy）。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41593-025-01919-0

2025年4月9日，中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心孫衍剛研究團隊在Neuron上發(fā)表了題為“Single-neuron projectome reveals organization of somatosensory ascending pathways in the mouse brain”的研究性論文。研究團隊創(chuàng)新性地結(jié)合了病毒示蹤和高分辨率成像和重構(gòu)技術(shù)(fMOST)，通過對脊髓神經(jīng)元和腦內(nèi)中繼神經(jīng)元的完整追蹤，最終構(gòu)建出了迄今為止最完整的體感神經(jīng)"高清地圖"，該高分辨率的單神經(jīng)元全腦投射譜的開放數(shù)據(jù)庫(https://mouse.digital-brain.cn/projectome/spcd），現(xiàn)已向全球開放。本研究全面揭示了脊髓投射神經(jīng)元與中樞中繼神經(jīng)元的投射模式及組織聯(lián)接規(guī)律，發(fā)現(xiàn)神經(jīng)元通過并行-發(fā)散-匯聚等投射模式構(gòu)建信息高速公路，更鑒定出多種投射模式特異的神經(jīng)元亞型，為理解疼痛、觸覺等感知覺神經(jīng)機制提供了全新結(jié)構(gòu)框架。研究團隊創(chuàng)建的開放數(shù)據(jù)庫已向全球科研人員免費開放，這將加速基礎(chǔ)和臨床研究相關(guān)領(lǐng)域的突破性發(fā)現(xiàn)，還將為人工智能的感知系統(tǒng)設(shè)計提供生物靈感。

原文鏈接:https://www.cell.com/neuron/abstract/S0896-6273(25)00179-5

2025年4月30日，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所王琰/蔣建東/王曉良團隊在Engineering上發(fā)表了題為“Berberine Protects Cerebral Vessels and Alleviates Diabetic Encephalopathy by Inhibiting the Production of δ-Valerobetaine in the Gut Microbiota”的研究論文。研究表明，BBR 在很大程度上改善了大腦中的血管，并通過抑制腸道微生物群中 δ-VB 的產(chǎn)生，從而中斷血管內(nèi)皮細(xì)胞中的TLR-4/MyD88/NF-κB炎癥途徑，進(jìn)而緩解DE。鑒于目前臨床上難以有效保護(hù)腦血管免受高血糖誘導(dǎo)的炎癥損傷，且小檗堿(BBR)已作為安全性良好的非處方藥廣泛應(yīng)用，這一發(fā)現(xiàn)具有重要的潛在轉(zhuǎn)化價值。.

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.eng.2025.04.018

2025年6月5日，臨港實驗室殷憲振團隊與中國科學(xué)院上海藥物研究所張繼穩(wěn)團隊合作在ACS Nano上發(fā)表了題為“Tracheal Targeted Nanogrid Delivery Systems of Dexamethasone Visualized by Single-Particle Tracing and Multiscale Pathological Mapping”的研究性論文，本文提出了“結(jié)構(gòu)藥劑學(xué)”的新理念，揭示了結(jié)構(gòu)與質(zhì)量之間的關(guān)系，并將該理念拓展至生命組織層面。結(jié)合跨尺度三維（3D）成像，遞藥系統(tǒng)在體內(nèi)的分布規(guī)律被精準(zhǔn)刻畫，這不僅為納米遞藥系統(tǒng)的設(shè)計與優(yōu)化提供了堅實基礎(chǔ)，也為個體化診療提供了新的思路與技術(shù)支撐。

原文鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.5c06694

2025年6月19日，由海南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院的駱清銘院士、生命健康學(xué)院的張智紅教授與劉征研究員團隊發(fā)表在《Nature Immunology》期刊上的這項具有里程碑意義的突破性研究，首次系統(tǒng)揭示了肝臟匯管區(qū)存在一類獨特的巨噬細(xì)胞亞群——CX3CR1+CD63+巨噬細(xì)胞（LPAMs）。通過結(jié)合三維介觀成像、熒光顯微光學(xué)切片斷層成像（fMOST）及單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析等技術(shù)，團隊首次揭示了匯管區(qū)巨噬細(xì)胞（LPAMs）的時空動態(tài)規(guī)律——其沿門靜脈形成管狀網(wǎng)絡(luò)，與交感神經(jīng)末梢建立物理連接，并通過CSF1R信號維持生存。更重要的是，該研究闡明了LPAMs在NASH病理進(jìn)程中的雙重保護(hù)機制：既通過誘導(dǎo)Treg細(xì)胞抑制炎癥風(fēng)暴，又通過神經(jīng)保護(hù)功能維持匯管區(qū)微環(huán)境穩(wěn)態(tài)。這一發(fā)現(xiàn)不僅填補了肝臟免疫學(xué)的基礎(chǔ)理論空白，更為代謝性肝病的治療提供了全新思路。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41590-025-02190-y

2025年7月2日，海南大學(xué)和華中科技大學(xué)的駱清銘院士/龔輝教授及美國加州大學(xué)洛杉磯分校董紅衛(wèi)教授團隊在Nature上發(fā)表了題為“A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution”的研究性論文。本研究發(fā)展了對完整小鼠腦進(jìn)行尼氏染色和樹脂固定的方法，利用駱清銘研究團隊自主研發(fā)的顯微光學(xué)切片斷層成像MOST技術(shù)，獲取了亞微米分辨的小鼠全腦細(xì)胞構(gòu)筑圖像，包括14,000張冠狀切面、11,400張矢狀切面和9,000張水平切面，三個標(biāo)準(zhǔn)解剖方位斷面圖像的數(shù)量都比傳統(tǒng)解剖圖譜高2個數(shù)量級，均能清晰分辨腦內(nèi)單個細(xì)胞和組織特征。通過結(jié)合細(xì)胞構(gòu)筑、免疫組化、原位雜交、神經(jīng)環(huán)路以及特定基因型神經(jīng)元分布等不同標(biāo)記策略所得圖像，該團隊首次構(gòu)建了各向同性1微米分辨率的三維小鼠腦參考圖譜（STAM），劃分并標(biāo)注了916個腦區(qū)的三維形貌，其中新命名腦亞區(qū)236個。

原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8

2025年7月10日，《Cell》期刊發(fā)表了中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）聯(lián)合華中科技大學(xué)蘇州腦空間信息研究院等團隊的題為《Single-neuron projectomes of macaque prefrontal cortex reveal refined axon targeting and arborization》的研究論文。本研究首次在單神經(jīng)元水平上系統(tǒng)重構(gòu)了獼猴前額葉的全腦連接網(wǎng)絡(luò)，揭示了獼猴前額葉神經(jīng)元在大腦中的連接規(guī)律。同時，本研究通過將獼猴與小鼠的前額葉單神經(jīng)元投射圖譜進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)靈長類神經(jīng)元具有高度精細(xì)化的結(jié)構(gòu)特點，為深入解析靈長類復(fù)雜認(rèn)知功能的神經(jīng)機制提供了理論基礎(chǔ)，對于啟發(fā)新一代人工智能具有重要意義。

原文鏈接：https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)00639-7?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867425006397%3Fshowall%3Dtrue

2025年7月23日，臨港實驗室殷憲振團隊與中國科學(xué)院上海藥物研究所張繼穩(wěn)、張小川團隊合作在Science Advances上發(fā)表了題為“Construction of a whole-brain panorama for gliomavasculature reveals tumor heterogeneity andblood-brain barrier disruption”的研究性論文。本位通過構(gòu)建不同階段腦膠質(zhì)瘤的亞微米級高精度3D圖譜，實現(xiàn)全腦尺度腫瘤血管系統(tǒng)與細(xì)胞構(gòu)筑的3D可視化，重點解析腫瘤血管病理重塑特征、血腦屏障通透性動態(tài)變化及納米粒子-腫瘤微環(huán)境交互關(guān)系，從而為闡釋腫瘤微環(huán)境與藥物遞送系統(tǒng)的互作關(guān)系提供清晰、直觀的認(rèn)識。

原文鏈接：https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adw8330

2025年7月23日，海南大學(xué)、華中科技大學(xué)蘇州腦科學(xué)研究所龔輝和李向?qū)幗淌趫F隊在Front Aging Neurosci上發(fā)表了題為“Vulnerability of long-range inputome of basal forebrain in normal aging mice”的研究性論文。該研究團隊將病毒示蹤和fMOST技術(shù)相結(jié)合，對正常小鼠衰老過程中基底前腦（BF）、海馬（Hip）和內(nèi)側(cè)前額葉皮質(zhì)（mPFC）的全腦輸入進(jìn)行了定量分析。長時程輸入研究表明，基底前腦（BF）的斜角帶核（NDB）區(qū)域易受損，特別是vCA3-NDB神經(jīng)環(huán)路的連接強度顯著減弱，這一現(xiàn)象可能與決策功能相關(guān)。通過對基底前腦各亞區(qū)三維連續(xù)數(shù)據(jù)的對比分析，發(fā)現(xiàn)衰老導(dǎo)致各區(qū)域與嗅覺區(qū)（OLF）之間的連接強度呈現(xiàn)拓?fù)潢P(guān)系依賴性減弱，該變化可能與學(xué)習(xí)記憶功能相關(guān)。這些研究成果為正常衰老過程中基底前腦環(huán)路選擇性易損機制提供了解剖學(xué)基礎(chǔ)，并為今后研究年齡相關(guān)認(rèn)知衰退的治療策略提供了新視角。

原文鏈接：https://doi.org/10.3389/fnagi.2025.1573906

2025年8月14日，空軍軍醫(yī)大學(xué)蔡國洪團隊在Cancers上發(fā)表了題為“High-Resolution Quantitative Reconstruction of Microvascular Architectures in Mouse Hepatocellular Carcinoma Models ”的研究性論文。該研究團隊采用fMOST成像技術(shù)，對正常和Akt / ras誘導(dǎo)的肝細(xì)胞癌（HCC）模型小鼠肝臟中的三維微血管結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明HCC組織中血管系統(tǒng)出現(xiàn)紊亂、受壓狀態(tài)，其中門靜脈（pv）——而非肝動脈（HAs）——成為彌漫性肝癌的主要供血通道。此外，肝硬化和腫瘤組織中的肝竇網(wǎng)絡(luò)被破壞，其表現(xiàn)為密度降低和血管半徑增大。這些發(fā)現(xiàn)挑戰(zhàn)了"肝動脈主導(dǎo)肝癌血流"的傳統(tǒng)觀點，可能解釋經(jīng)肝動脈化療栓塞術(shù)（TACE）在彌漫性肝癌療效有限的原因。該研究以高分辨率解析了肝臟血管系統(tǒng)的解剖特征，為改進(jìn)腫瘤靶向治療策略提供了理論基礎(chǔ)。

原文鏈接：https://doi.org/10.3390/cancers17162653

2025年8月18日，來自陸軍軍醫(yī)大學(xué)（第三軍醫(yī)大學(xué)）西南醫(yī)院腦膠質(zhì)瘤醫(yī)學(xué)研究中心卞修武院士團隊（病理科）聯(lián)合馮華教授團隊（神經(jīng)外科）和無錫第904醫(yī)院神經(jīng)外科王玉海教授，合作在Cancer Cell雜志在線發(fā)表了題為Long-range Cholinergic Input Promotes Glioblastoma Progression的研究論文。在繪制神經(jīng)元-膠質(zhì)瘤細(xì)胞全腦連接圖譜的基礎(chǔ)上，團隊首次在環(huán)路層面系統(tǒng)揭示了遠(yuǎn)距離膽堿能神經(jīng)元調(diào)控對GBM進(jìn)展的影響，以及不同神經(jīng)遞質(zhì)對GBM進(jìn)展的作用與機制，并發(fā)現(xiàn)東莨菪堿抗GBM作用（“老藥新用”），同時警示乙酰膽堿酯酶抑制劑可能具有加速GBM進(jìn)展的風(fēng)險，為“癌癥神經(jīng)科學(xué)”（Cancer Neuroscience）提供了嶄新認(rèn)識和研究范式。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.ccell.2025.07.024

2025年8月29日，浙江中醫(yī)藥大學(xué)陳忠教授團隊與海南大學(xué)駱清銘院士團隊合作，在Nature Communications 期刊上發(fā)表了題為 ：A whole-brain male mouse atlas of long-range inputs to histaminergic neurons的研究論文。該研究利用狂犬病毒單突觸逆行示蹤結(jié)合高分辨率fMOST成像，首次在全腦范圍內(nèi)、單細(xì)胞分辨率下，繪制了雄性小鼠組胺能神經(jīng)元的長程輸入圖譜，并結(jié)合電生理、光纖記錄和化學(xué)遺傳學(xué)等實驗，解析了關(guān)鍵輸入環(huán)路對睡眠-覺醒行為的調(diào)控作用。這項研究為理解睡眠障礙、情緒障礙等疾病提供了新的解剖和功能基礎(chǔ)。

原文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41467-025-63394-2

2025年9月8日，重慶腦與智能科學(xué)中心諶小維、重慶醫(yī)科大學(xué)汪萌、陸軍軍醫(yī)大學(xué)余爭平團隊在Fundamental Research上發(fā)表了題為“Brain-wide atlas of outputs and inputs of mouse auditory cortex revealed by modified viral labeling strategies”的研究性論文。該研究團隊創(chuàng)新性地將核定位熒光標(biāo)記融入逆行與單突觸順行病毒追蹤策略，結(jié)合fMOST技術(shù)，實現(xiàn)了對小鼠聽覺皮層（ACx）輸入 - 輸出關(guān)系的精準(zhǔn)定位，為解決傳統(tǒng)方法的技術(shù)瓶頸提供了全新方案。此前研究認(rèn)為聽覺皮層對初級軀體感覺皮層（SSp）與初級視覺皮層（VISp）這些區(qū)域的投射主要集中在 1-3 層，而本研究證實，投射主要局限于第 5 層，1-3 層僅存在稀疏分布；首次發(fā)現(xiàn)聽覺皮層存在直接投射至胼胝體（CC）的神經(jīng)元。作為連接左右大腦半球的主要神經(jīng)束，胼胝體此前未被發(fā)現(xiàn)與聽覺皮層存在直接連接，這一發(fā)現(xiàn)為跨半球聽覺信息交互機制提供了全新研究方向。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.fmre.2025.08.014

2025年9月17日，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所吳青峰團隊聯(lián)合北京生命科學(xué)研究所曹鵬研究員在Neuron雜志在線發(fā)表題為“Identification of a neural basis for energy expenditure in the mouse arcuate hypothalamus”的文章。該研究鑒定了一類位于下丘腦弓狀核的GABA能Crabp1神經(jīng)元，發(fā)現(xiàn)它們通過作用于多個下游核團促進(jìn)能量消耗。這類神經(jīng)元在寒冷或運動條件下被激活，而在長時間光照下被抑制，將環(huán)境和生理信號與代謝穩(wěn)態(tài)緊密聯(lián)系，為肥胖干預(yù)提供了新的潛在靶點。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.neuron.2025.08.021

2025年11月17日，《Neuron》期刊在線發(fā)表了中國科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心（神經(jīng)科學(xué)研究所）聯(lián)合華中科技大學(xué)蘇州腦空間信息研究院等團隊的題為" Integrative analysis of single-neuron projectomes links connectome, transcriptome, and function in the mouse cortex "的研究論文。該研究重構(gòu)了近2萬個覆蓋小鼠皮層所有腦區(qū)投射神經(jīng)元的軸突完整形態(tài)，提供了迄今為止最大的小鼠單神經(jīng)元投射圖譜數(shù)據(jù)集，揭示了皮層投射神經(jīng)元在皮層內(nèi)聯(lián)結(jié)和皮層下腦區(qū)投射的規(guī)律，并通過整合分析發(fā)現(xiàn)了皮層內(nèi)部聯(lián)結(jié)與轉(zhuǎn)錄組和神經(jīng)元功能之間的密切關(guān)系。

原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.neuron.2025.10.019

2025年11月19日，海南大學(xué)和華中科技大學(xué)的駱清銘院士、李向?qū)幗淌诤屠畎舶步淌诠餐鳛橥ㄓ嵶髡?，在?/font>Nature Communications》期刊在線發(fā)表題為Molecularly defined cellular atlas of the entire mouse brain with isotropic single-cell resolution的研究成果。研究團隊成功研發(fā)了全腦細(xì)胞架構(gòu)解析平臺（BrainCAD），該平臺整合了轉(zhuǎn)基因小鼠模型與熒光顯微光學(xué)切片斷層成像（fMOST）技術(shù)，能夠以前所未有的清晰度和數(shù)據(jù)完整性，獲取小鼠全腦的連續(xù)圖像。其成像體素分辨率達(dá)到了0.3μm × 0.3μm × 1μm，每套小鼠腦數(shù)據(jù)包含超過1.1萬張完整冠狀面圖像——這一技術(shù)突破不僅能清晰識別腦內(nèi)所有被標(biāo)記的單個細(xì)胞，還可通過同步獲取的細(xì)胞構(gòu)筑參考圖像，將目標(biāo)細(xì)胞精準(zhǔn)映射到參考腦模板，包括艾倫小鼠腦通用坐標(biāo)框架（Allen CCF v3）及駱清銘團隊發(fā)表于《NATURE》的小鼠三維立體定位圖譜（STAM），為全球科研人員提供了統(tǒng)一、精準(zhǔn)的研究參照體系。